Rzeka Krutynia jest doskonałym miejscem na uprawianie wędkarstwa. Pamiętać należy, że w tym regionie kłusownictwo – a tak określane jest łowienie ryb bez karty wędkarskiej oraz posiadania stosowanego zezwolenia, jest surowo i konsekwentnie karane.
Wędkowanie na rzece Krutyni oraz na szlaku jest możliwe. Konieczne jest posiadanie odpowiedniego zezwolenia na wędkowanie. Z możliwości połowu ryb całkowicie wyłączono jezioro Krutyńskie oraz odcinek rzeki biegnący od miejscowości Ukta do wsi Iznoty.
Pozostała część szlaku podzielona jest na 3 części podlegające odmiennym zarządcom uprawnionym do wydawania zezwoleń na połów ryb.
Część pierwsza zawierająca odcinek od Sorkwitu po Jezioro Krutyńskie podlega Gospodarstwu Rybackiemu w Mrągowie. Część druga to fragment przebiegający poniżej jeziora Krutyńskiego do wsi Ukta podlega PZW Olszyn, a odcinek stanowiący część rzeki od miejscowości Iznoty (Most) po Jezioro Bełdany jest w zarządzie Gospodarstwa Rybackiego w Mikołajkach.